Сейчас леса занимают в Подмосковье 42 % территории, площадь 2168 тыс. га. В основном, это вторичные леса на месте вырубок и полей. От коренных лесов они отличаются значительной примесью березы и осины, а также более простой структурой. В Москве более 40 лесных массивов. Сосняки занимают 21 % их площади, самый крупный массив — в Серебряном Бору (возраст — до 170 лет). Ельники составляют 2 %, они не устойчивы к загрязнению и сохранились в немногих местах; самые старые — свыше 130 лет — находятся в глубине Лосиного Острова. Луга в Московской области занимают около 3 % территории. Они возникли в основном на месте лесов. Выделяют пойменные и суходольные луга.

Пойменные луга имеют большое хозяйственное значение: здесь сосредоточены основные массивы сенокосов и пастбищ. Основные растения: канареечник, пырей ползучий, костер безостый, полевицы, овсяницы, мятлики, вейники, нивянник, василек луговой, зверобой продырявленный, герань луговая, колокольчик сборный, вербейник обыкновенный, таволга вязолистная, подмаренники и многие другие. Когда-то болота в Подмосковье занимали обширные пространства. Сейчас в результате торфодобычи и осушения они составляют менее 2 % территории области. На низинных болотах обычно растут черная ольха и пушистая береза, а из кустов и трав — черная смородина, хмель, осоки, тростник, таволга вязолистная, вахта. Они широко распространены в поймах рек.

В Московской области встречается около 2 тыс. видов грибов, из них шляпочных — примерно 900 видов. Почти половина из них — съедобные. В городе растут многие виды, но собирать их не рекомендуется, т.к. грибы накапливают в себе некоторые ядовитые вещества. В Московской области встречается около 400 видов мхов, из них около 200 видов встречается в Москве. Самая богатая и интересная бриофлора (более 120 видов) сохранилась в Фили-Кунцевском парке.